本学会は、1975年8月に設立された「日本コルポスコピー研究会」を源流とし、「日本子宮頸部病理・コルポスコピー研究会」、「日本婦人科病理・コルポスコピー学会」を経て、さらに「日本卵巣腫瘍病理研究会」と合流し、1998年の「日本婦人科腫瘍学会」を礎石としています。当時の婦人科腫瘍学は、分野別に複数の学会に細分化され扱われており、また海外学会の窓口となる機構がなかったこと、などから婦人科腫瘍学全般を網羅・集約する学会設立の必要性が高まっていました。このため、「子宮癌研究会」、「日本婦人科悪性腫瘍化学療法学会」、「日本婦人科腫瘍マーカー・遺伝子診断学会」とともに４つの組織が新たに１つに統合され、2013年11月に現在の「公益社団法人日本婦人科腫瘍学会」へと発展、2020年には日本医学会の分科会となり、2023年に四半世紀を迎えます。1982年には約560名だった会員数も、現在4000名を超え、婦人科腫瘍分野の医師のほか、病理診断医や放射線治療医、腫瘍内科医、コメディカルスタッフが主な会員構成です。本学会は他科と密に連携し、様々な婦人科癌の治療ガイドラインを作成するなど、診療指針の立案・策定を担うほか、婦人科腫瘍専門医制度の運営、市民公開講座の開催や一般向けガイドライン作成など多くの社会貢献活動を行っています。